关于景杰 About us
公司简介

血液是临床中最为常用的检测标本,其中的蛋白质变化作为标志物可以指征多种疾病的发生和进展。从常规体检的谷丙转氨酶,到癌症诊断的AFP、CA125等蛋白指标,都为临床诊断提供了不可或缺的重要信息。近年来,随着质谱技术的进步,通过组学方法来筛选新的血液标志物,已经成为了一个越来越重要的研究和转化应用的方向。

血液分析难点

血液因其特殊的蛋白质组成结构,使得其在组学层面上检测一直面临着较大的困难。这主要有两个方面的原因:

首先,相比于一般的组织细胞类样本,血液蛋白质含量的数量级跨度更大——可达1012数量级(图1),也就意味着有些蛋白含量很高,而有些蛋白的含量又极低。这种情况对仪器检测来说是巨大的挑战,很难有仪器能横跨如此大的检测范围。

其二,这些蛋白质不但含量差异大,而且分布非常不均匀。在血浆/血清样品中,仅仅血清白蛋白(HSA)这一个蛋白,就占据了全部蛋白约50%的含量;而前22种蛋白的集合,更是占据了全部蛋白99%的含量;剩下上万种蛋白加起来,只占了不到1%的份额。

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

图1. 血液中蛋白质含量的数量级分布

为了应对高丰度蛋白的挑战,目前普遍使用的做法是使用试剂盒去除高丰度蛋白,但是由于高丰度蛋白含量极高,抗体试剂盒的去除不可能完全,其残留的蛋白仍然足以对蛋白组检测产生显著的影响。

而另一方面,人们也在通过调整质谱设置的方式进行优化,例如DDA进行HPLC预分级、DIA建立历史库等方式来尽量提高检测深度。但是即便如此,普遍的检测深度仍然多数徘徊在500-600的深度范围[1,2],并且这些方式如果过度使用来一味追求更高检测深度,不但会大大增加成本,而且将对鉴定和定量的可靠性带来负面影响。

那么,是否有其他的方式来解决高丰度蛋白的困扰呢?

基于FAIMS解决血液分析难点

FAIMS装置的引入提供了一个新的思路。

FAIMS是一种气态的离子过滤装置,通过电场的作用可以使得某些离子信号被偏转出去,从而降低样品的复杂度,有利于后续质谱对肽段信号的鉴定,在常规的细胞和组织样品中,可以提高大约10%-20%的检测深度。

FAIMS“离子过滤”的原理,在面对血液这种高丰度蛋白干扰严重的样品时,其长处恰恰能够得到最大化的发挥。根据实际测试的结果,通过FAIMS装置进一步过滤筛选掉高丰度的干扰信号,能够将血液的检测深度从600多提升到1000,提升超过50%的幅度(图2左),同时能够保持良好的定量平行性(图2右)。

图2。 左,使用FAIMS前后的血浆蛋白质鉴定数目;右,使用FAIMS的两次技术重复的平行性分析

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

基于FAIMS的血液蛋白组检测,相比于传统的方法有一系列的优势。

  • 相比于传统TMT的方法,其不受制于标记通道数的限制,适用性更加广泛;

  • 相比于传统的DDA方法,其不会造成大规模分级而推高的成本;

  • 相比于传统的DIA方法,其在实现蛋白组深度覆盖的同时不会牺牲鉴定的可靠性。

“Blood+”血液蛋白质组

景杰生物率先独家推出整合FAIMS离子过滤技术机器学习标志物筛选的“Blood+”血液蛋白质组方法,特别适合于大规模队列样本的分析,为血液标志物筛选提供新的强大工具。

详情可微信后台留言或致电400-100-1145。

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

参考文献

1. Lili Niu, et al. (2019) Plasma proteome profiling discovers novel proteins associated with non-alcoholic fatty liver disease. Molecular Systems Biology.

2. Yansheng Liu, et al. (2015) Quantitative variability of 342 plasma proteins in a human twin population. Molecular Systems Biology。


血液是临床中最为常用的检测标本,其中的蛋白质变化作为标志物可以指征多种疾病的发生和进展。从常规体检的谷丙转氨酶,到癌症诊断的AFP、CA125等蛋白指标,都为临床诊断提供了不可或缺的重要信息。近年来,随着质谱技术的进步,通过组学方法来筛选新的血液标志物,已经成为了一个越来越重要的研究和转化应用的方向。

血液分析难点

血液因其特殊的蛋白质组成结构,使得其在组学层面上检测一直面临着较大的困难。这主要有两个方面的原因:

首先,相比于一般的组织细胞类样本,血液蛋白质含量的数量级跨度更大——可达1012数量级(图1),也就意味着有些蛋白含量很高,而有些蛋白的含量又极低。这种情况对仪器检测来说是巨大的挑战,很难有仪器能横跨如此大的检测范围。

其二,这些蛋白质不但含量差异大,而且分布非常不均匀。在血浆/血清样品中,仅仅血清白蛋白(HSA)这一个蛋白,就占据了全部蛋白约50%的含量;而前22种蛋白的集合,更是占据了全部蛋白99%的含量;剩下上万种蛋白加起来,只占了不到1%的份额。

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

图1。 血液中蛋白质含量的数量级分布

为了应对高丰度蛋白的挑战,目前普遍使用的做法是使用试剂盒去除高丰度蛋白,但是由于高丰度蛋白含量极高,抗体试剂盒的去除不可能完全,其残留的蛋白仍然足以对蛋白组检测产生显著的影响。

而另一方面,人们也在通过调整质谱设置的方式进行优化,例如DDA进行HPLC预分级、DIA建立历史库等方式来尽量提高检测深度。但是即便如此,普遍的检测深度仍然多数徘徊在500-600的深度范围[1,2],并且这些方式如果过度使用来一味追求更高检测深度,不但会大大增加成本,而且将对鉴定和定量的可靠性带来负面影响。

那么,是否有其他的方式来解决高丰度蛋白的困扰呢?

基于FAIMS解决血液分析难点

FAIMS装置的引入提供了一个新的思路。

FAIMS是一种气态的离子过滤装置,通过电场的作用可以使得某些离子信号被偏转出去,从而降低样品的复杂度,有利于后续质谱对肽段信号的鉴定,在常规的细胞和组织样品中,可以提高大约10%-20%的检测深度。

FAIMS“离子过滤”的原理,在面对血液这种高丰度蛋白干扰严重的样品时,其长处恰恰能够得到最大化的发挥。根据实际测试的结果,通过FAIMS装置进一步过滤筛选掉高丰度的干扰信号,能够将血液的检测深度从600多提升到1000,提升超过50%的幅度(图2左),同时能够保持良好的定量平行性(图2右)。

图2. 左,使用FAIMS前后的血浆蛋白质鉴定数目;右,使用FAIMS的两次技术重复的平行性分析

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

基于FAIMS的血液蛋白组检测,相比于传统的方法有一系列的优势。

  • 相比于传统TMT的方法,其不受制于标记通道数的限制,适用性更加广泛;

  • 相比于传统的DDA方法,其不会造成大规模分级而推高的成本;

  • 相比于传统的DIA方法,其在实现蛋白组深度覆盖的同时不会牺牲鉴定的可靠性。

“Blood+”血液蛋白质组

景杰生物率先独家推出整合FAIMS离子过滤技术机器学习标志物筛选的“Blood+”血液蛋白质组方法,特别适合于大规模队列样本的分析,为血液标志物筛选提供新的强大工具。

详情可微信后台留言或致电400-100-1145。

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

参考文献

1. Lili Niu, et al. (2019) Plasma proteome profiling discovers novel proteins associated with non-alcoholic fatty liver disease. Molecular Systems Biology。

2. Yansheng Liu, et al. (2015) Quantitative variability of 342 plasma proteins in a human twin population. Molecular Systems Biology。


技术平台
  • Orbitrap Fusion Lumos质谱仪
    Orbitrap Fusion Lumos质谱仪

    Orbitrap Fusion Lumos质谱仪是四极杆-静电场轨道阱-线性离子阱三合一组合式质谱,具有无以伦比的分析性能、创新型的分析深度、可操作性以及可靠性,能够以比现有商业化仪器更快的速度识别更多低丰度蛋白,非常适合蛋白质组学中复杂体系的高通量蛋白检测。


  • Q Exactive HF-X质谱仪
    Q Exactive HF-X质谱仪

    Q Exactive HF-X质谱仪为 Thermo QE系列最新款,应用改进的大容量离子 传输管及电动离子漏斗结构,极大提高离子传输效率及仪器灵敏度,同时通过优化扫描时间设置极大提升扫描速度(40 HZ)结合上高级峰值算法(APD),实现灵敏度、扫描速度及分辨率的大幅度提升。


  • Orbitrap Fusion质谱仪
    Orbitrap Fusion质谱仪

    Fusion使用的Orbitrap为超高场Orbitrap质量分析器,相比于赛默飞其他Orbitrap系列产品,Fusion具有超高分辨、高灵敏度、多级质谱能力,并且配备多种裂解模式(CID、HCD及可升级的ETD),非常适合蛋白质组学中复杂体系的高通量蛋白检测。


  • Q Exactive Plus质谱仪
    Q Exactive Plus质谱仪

    组合型四极杆 Orbitrap™ 质谱仪以更出色的性能和全新的选项使蛋白质定量迈进一步,从可靠的定性/定量筛查研究到完整单克隆抗体的表征,不同领域的应用能力都得到提升 。


  • Q Exactive 质谱仪
    Q Exactive 质谱仪

    将四极杆母离子选择性与高分辨率和准确质量数(HRAM)Orbitrap 检测相结合,提供出色性能和多功能性。 Q Exactive 质谱仪特别适用于非目标或目标化合物筛查,也能够实现广泛的定性和定量应用,可广泛用于药物发现、蛋白质组学、环境和食品安全、临床研究等。


  •  Tims-TOF Pro质谱系统
    Tims-TOF Pro质谱系统

    Bruker Tims-TOF Pro质谱仪器是Bruker最新推出的质谱分析系统,因其独特的PASEF功能,自己超高灵敏度、超高速度蛋白质组学分析能力,曾荣获2018 年度ANTOP蛋白质组学研究质谱技术突破奖。近日在德国波兹坦举办的EuPA 2019上,因其卓越性能,再度荣膺EuPA最佳技术奖。 


企业文化 Corporate culture

血液是临床中最为常用的检测标本,其中的蛋白质变化作为标志物可以指征多种疾病的发生和进展。从常规体检的谷丙转氨酶,到癌症诊断的AFP、CA125等蛋白指标,都为临床诊断提供了不可或缺的重要信息。近年来,随着质谱技术的进步,通过组学方法来筛选新的血液标志物,已经成为了一个越来越重要的研究和转化应用的方向。

血液分析难点

血液因其特殊的蛋白质组成结构,使得其在组学层面上检测一直面临着较大的困难。这主要有两个方面的原因:

首先,相比于一般的组织细胞类样本,血液蛋白质含量的数量级跨度更大——可达1012数量级(图1),也就意味着有些蛋白含量很高,而有些蛋白的含量又极低。这种情况对仪器检测来说是巨大的挑战,很难有仪器能横跨如此大的检测范围。

其二,这些蛋白质不但含量差异大,而且分布非常不均匀。在血浆/血清样品中,仅仅血清白蛋白(HSA)这一个蛋白,就占据了全部蛋白约50%的含量;而前22种蛋白的集合,更是占据了全部蛋白99%的含量;剩下上万种蛋白加起来,只占了不到1%的份额。

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

图1. 血液中蛋白质含量的数量级分布

为了应对高丰度蛋白的挑战,目前普遍使用的做法是使用试剂盒去除高丰度蛋白,但是由于高丰度蛋白含量极高,抗体试剂盒的去除不可能完全,其残留的蛋白仍然足以对蛋白组检测产生显著的影响。

而另一方面,人们也在通过调整质谱设置的方式进行优化,例如DDA进行HPLC预分级、DIA建立历史库等方式来尽量提高检测深度。但是即便如此,普遍的检测深度仍然多数徘徊在500-600的深度范围[1,2],并且这些方式如果过度使用来一味追求更高检测深度,不但会大大增加成本,而且将对鉴定和定量的可靠性带来负面影响。

那么,是否有其他的方式来解决高丰度蛋白的困扰呢?

基于FAIMS解决血液分析难点

FAIMS装置的引入提供了一个新的思路。

FAIMS是一种气态的离子过滤装置,通过电场的作用可以使得某些离子信号被偏转出去,从而降低样品的复杂度,有利于后续质谱对肽段信号的鉴定,在常规的细胞和组织样品中,可以提高大约10%-20%的检测深度。

FAIMS“离子过滤”的原理,在面对血液这种高丰度蛋白干扰严重的样品时,其长处恰恰能够得到最大化的发挥。根据实际测试的结果,通过FAIMS装置进一步过滤筛选掉高丰度的干扰信号,能够将血液的检测深度从600多提升到1000,提升超过50%的幅度(图2左),同时能够保持良好的定量平行性(图2右)。

图2. 左,使用FAIMS前后的血浆蛋白质鉴定数目;右,使用FAIMS的两次技术重复的平行性分析

“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

基于FAIMS的血液蛋白组检测,相比于传统的方法有一系列的优势。

  • 相比于传统TMT的方法,其不受制于标记通道数的限制,适用性更加广泛;

  • 相比于传统的DDA方法,其不会造成大规模分级而推高的成本;

  • 相比于传统的DIA方法,其在实现蛋白组深度覆盖的同时不会牺牲鉴定的可靠性。

“Blood+”血液蛋白质组

景杰生物率先独家推出整合FAIMS离子过滤技术机器学习标志物筛选的“Blood+”血液蛋白质组方法,特别适合于大规模队列样本的分析,为血液标志物筛选提供新的强大工具。

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“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级

参考文献

1. Lili Niu, et al. (2019) Plasma proteome profiling discovers novel proteins associated with non-alcoholic fatty liver disease. Molecular Systems Biology.

2. Yansheng Liu, et al. (2015) Quantitative variability of 342 plasma proteins in a human twin population. Molecular Systems Biology.


科学顾问团队 Scientific advisory team
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  • 荣誉证书
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  • 杭州经济技术开发区管理委员会文件
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  • 中共杭州市委人才工作领导小组文件
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  • 杭州市“雄鹰计划”企业
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