市场与支持 News
不久前我们回顾了2019年度蛋白质组学领域的精选研究,在过去的一年里,数十篇蛋白质组学相关的研究应用见刊于CNS等顶级期刊,为生命科学与精准医学领域增添了浓墨重彩的一笔(详情请点击:硕果累累,2019年蛋白质组学精华研究盘点)。更加让人振奋的是,过去的几年,随着我国科研人员的不懈努力,再加上国家对蛋白质组学研究的稳步支持,中国蛋白质组学研究实现了跨越式的发展,高水平的研究论文层出不穷。今天,编者精选了2019年度,国内外华人学者在Cell、Science、Nature发表的蛋白质组与蛋白质修饰组学研究成果,以飨读者。排序按照发表时间,不分先后。中国人类蛋白质组计划发现肝癌精准治疗新靶点:Proteomics identifies therapeutic targets of early-stage hepatocellular carcinoma2019年2月28日,Nature在线发表了军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、蛋白质组学国家重点实验室贺福初院士团队、钱小红教授团队联合复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队等开展的早期肝细胞癌蛋白质组研究成果。研究首次描绘了早期肝细胞癌的蛋白质组表达谱和磷酸化蛋白质组图谱,发现了肝癌精准治疗的新靶点。点击图片查看详细解读研究人员运用蛋白质组学和磷酸化组学等技术,针对110个与乙型肝炎病毒感染相关的临床早期肝细胞。。。
发布时间: 2020 - 01 - 18
“蛋白组学·2019”线上文献阅读大赛开赛以来,陆续收到了很多参赛作品。经过评审团队精心的审阅、筛选,优秀参赛作品将陆续在“精准医学与蛋白组学”学术平台发布。此次活动由蛋白组学、修饰组学的领军企业——景杰生物独家支持,更多精彩活动,期待你的参与~~~参赛者:金梓婧 (上海交通大学基础医学院)参赛作品:全身性幼年特发性关节炎不同炎症表型的分子特征文章名称:Molecular signature characterisation of different inflammatory phenotypes of systemic juvenile idiopathic arthritis发表期刊:Ann Rheum Dis(IF=14.299)发表日期:2019年4月全身性幼年特发性关节炎(Systemic juvenile idiopathic arthritis, SJIA)是一种不明机制的自发炎症疾病,占幼年特发性关节炎(JIA)的10%-15%。国际类风湿学协会联盟对SJIA的判定标准是连续2周发热、短暂的皮疹以及慢性关节炎。然而在SJIA的早期,关节炎的症状表现得很少,甚至不存在。而其他的疾病,比如由感染引起的一些疾病,与SJIA有着相似的症状,这就使得SJIA的早期诊断难度大幅度增加。众所周知,早期的诊断是开展有效靶向治疗的重要方法,所以找到能够确诊早期SJ...
发布时间: 2020 - 01 - 15
光阴似箭,岁月如梭,2019年的岁月转瞬即逝, 2020新年钟声已然叩响了新新一年的大门。在过去的2019年里,蛋白质组学,尤其是修饰组学研究蓬勃发展,劈波斩浪,接连取得重大突破,数十篇相关的研究应用见刊于CNS等顶级期刊,为生命科学与精准医学领域增添了浓墨重彩的一笔。在此,我们汇总了蛋白质组学、与翻译后修饰领域在2019年的精华研究。一起来看一下2019年中,蛋白质组学都取得了哪些重要突破?2019。02中国人类蛋白质组计划发现肝癌精准治疗新靶点doi:10。1038/s41586-019-0987-82019年2月28日,Nature在线发表了军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、蛋白质组学国家重点实验室贺福初院士团队、钱小红教授团队联合复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队等开展的早期肝细胞癌蛋白质组研究成果。研究首次描绘了早期肝细胞癌的蛋白质组表达谱和磷酸化蛋白质组图谱,发现了肝癌精准治疗的新靶点。肠道微生物通过亚硝基化修饰影响宿主doi:10。1016/j。cell。2019。01。037通过代谢物扩散并影响蛋白质的修饰和功能,是肠道微生物群落对宿主发挥调控作用的重要机制。2019年2月21日,凯斯西储大学医学院和克利夫兰医学中心的Jonathan S。 Stamler研究团队在Cell发文,运用亚硝基化修饰组学,发现肠道微生物产生的一氧化氮(NO。。。
发布时间: 2020 - 01 - 13
“蛋白组学·2019”线上文献阅读大赛开赛以来,陆续收到了很多参赛作品。经过评审团队精心的审阅、筛选,优秀参赛作品将陆续在“精准医学与蛋白组学”学术平台发布。公众号由蛋白组学、修饰组学的领军企业——景杰生物独家支持,更多精彩活动,期待你的参与~~~参赛者:焦佳琪 (广东省微生物研究所)参赛作品:EGFR-ROCK联合抑制细胞保护性自噬,有望攻克三阴性乳腺癌文献标题: Combined EGFR and ROCK inhibition in TNBC leads to cell death via impaired autophagic flux发表期刊:MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS发表时间:2019.11三阴性乳腺癌(TNBC)是一种侵略性乳腺癌,其对既定的激素治疗和/或HER2靶向治疗不敏感,而传统的外科手术和全身疗法的治疗手段存在常见的耐药性复发。表皮生长因子受体(EGFR)是TNBC的潜在治疗靶标。近期研究显示,当RAF-MEK-ERK级联抑制剂与自噬抑制联合作用时具有很好的协同抗肿瘤活性。巨噬细胞自噬(简称自噬)是一种高度动态的自吞噬生物过程。癌症情况下,自噬的激活具有两面性,它能够通过清除受损细胞器、维持细胞稳态和保护正常细胞生长而起到抑癌作用,但也可能成为多种压力下肿瘤细胞的关键生存机制。越来越多的证据表明,...
发布时间: 2020 - 01 - 08
“蛋白组学·2019”线上文献阅读大赛开赛以来,陆续收到了很多参赛作品。经过评审团队精心的审阅、筛选,优秀参赛作品将陆续在“精准医学与蛋白组学”学术平台发布。此次活动由蛋白组学、修饰组学的领军企业——景杰生物独家支持,更多精彩活动,期待你的参与~~~参赛者:刘*昕 (东北林业大学)参赛作品:整合组学分析揭示丙型肝炎病毒侵染的信号通路变化文献标题:Combined Analysis of Metabolomes, Proteomes, and Transcriptomes of Hepatitis C Virus–Infected Cells and Liver to Identify Pathways Associated With Disease Development发表期刊:Gastroenterology(IF = 19。233 )发表时间:2019。08丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)导致肝脏的急性和慢性感染,这是导致肝脏疾病从慢性炎症和代谢性疾病发展为纤维化、肝硬化,最终发展为肝细胞癌(HCC)的主要原因。然而目前,对丙型肝炎病毒的感染、肝病的恶化、肝癌的形成了解不够完全。2019年8月,国际专业学术期刊Gastroenterology(IF = 19。233 )发表了题为Combined Analysis of Metab。。。
发布时间: 2020 - 01 - 06
近年来,SARS、口蹄疫、疯牛病、狗流感、与猴天花等,这些新出现的各种感染性疾病频频突袭人类,已经给人类造成了灾难性危害。通常情况下在动物间传播的病毒很难在人与人之间传播。但是,一旦与之相关的病毒在适应人类后,实现了有效的复制和扩增,就会造成人群间大流行。甲型流感是典型的“人畜共患病”,具有很高的发病率和死亡率。甲型流感病毒(IAV)是一种带有分段基因组的负义单链RNA病毒,可以感染哺乳动物和鸟类。但是,在鸟类中复制的毒株通常不会感染哺乳动物,当具有新抗原性的禽源流感病毒株获得在人之间传播的能力时,就会引发严重的疫情。因此,了解宿主特异性的分子基础具有重要的医学意义。1918年开始流行的西班牙流感造成了约5%的人类死亡。图片来源:维基百科近日,德国马克斯·德尔布吕克分子医学中心Matthias Selbach教授在国际专业学术期刊Nature Communications上发文,使用代谢脉冲标记和定量质谱技术比较人类适应的 IAV病毒株和鸟类适应的 IAV病毒株侵染人细胞后的蛋白质组动力学。研究者发现宿主蛋白的行为非常相似,但是病毒蛋白的产生却有很大差异,尤其是对于基质蛋白M1,M节段中一段保守的顺式调控元件是流感病毒侵染宿主的决定因素。文章精读1。 IAV感染的动态蛋白质组分析为了评估IAV的物种特异性的决定因素,研究者使用模型系统,比较了低致病性禽类H3N2 IAV(。。。
发布时间: 2020 - 01 - 03
编辑注 | 我们一直致力于打造蛋白质组学领域最自由的学术交流平台,专家视界是我们的一次尝试。我们会不定期邀请领域内的专家与学者,或分享他们的见解、体验和对未来的展望,内容涉及科研、临床、运用等蛋白质组学各个方向,欢迎关注!本文经授权转载自徐旭东科学网博客,分享一段关于:微藻,南极和“青稞”的科学故事。原文 | 徐旭东 (中科院水生生物研究所研究员)提示:爱好生物学的可从第一段读起,爱好“青稞”(青科)靓照和辛酸故事的请直奔最后部分。如果你看多了那些神人神操作的故事,或许在我们普通人之间对于科研和职业精神的朴实理解更有惺惺相惜的感觉。地球上最冷的区域当数南极大陆。那里最低气温可达到-89.2℃,约有99.8%的面积被平均2公里厚的冰层覆盖(图1)。虽然如此,在没有冰盖的区域地表温度常年在-35℃~ 5℃范围内波动。南极的动植物生活在有季节性融水的无冰盖区域,而微藻和其他微生物则不仅生活于这些区域,还能生活于雪地、海冰和封存于冰盖之下的湖泊之中。南极与其他大陆的动植物群落相互隔绝,但是其他大陆的微生物却可以通过大气层流等途径达到南极。图1. 南极正面观。一些山脊(右上角图)和海岸带(右下角)有裸露的陆地(网络下载图片)南极为何如此寒冷?在地质史上,南极是从冈瓦纳大陆分离出来的。约在3400万年到3300万年前,CO2浓度和气温骤降,冰层覆盖南极。约2300万年前,南...
发布时间: 2019 - 12 - 30
随着以4D技术为代表的质谱方法的不断进步,蛋白质组学也逐渐从基础研究进入到了临床分析的领域。由于蛋白质是功能的执行者和药物的直接靶点,因此蛋白质组学在临床方面的应用进展一直备受瞩目。然后目前的临床蛋白质组学研究,多数仍然是以新鲜或冰冻组织为样本进行的。这些样品往往缺乏足够长的随访信息,导致了其实际的研究意义受限。另一方面,FFPE是临床一直以来最常用的样品保存方法,这类样品不但数量多、而且时间长、随访信息完整,如果能够将这些样品应用于蛋白质组学分析,无疑会具有更好的临床价值【1-4】。景杰生物已于近期隆重推出4D技术新应用-福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPE)样本定量蛋白质组学,助力各位老师的研究。 图1. 基于石蜡包埋样本的蛋白质组学流程相较于传统3D技术方法,基于4D平台的蛋白质组学无论是在鉴定深度还是准确性上都能带来全面的提升。我们最新的测试结果显示,不同类型 FFPE 肿瘤组织样本的4D蛋白质组学可鉴定约4000个蛋白,其中骨肉瘤(Osteo sarcoma)能鉴定超过4500个蛋白,前列腺癌(Prostate cancer)能鉴定约4000个蛋白,肾母细胞瘤(nephroblastoma) 能鉴定超过5000个蛋白,部分结果如图2所示。图2. 基于4D平台的FFPE蛋白质组学测试结果产品类型:基于4D平台的Label-free蛋白质组学送样标准:3-5...
发布时间: 2019 - 12 - 25
随着以4D技术为代表的质谱方法的不断进步,蛋白质组学也逐渐从基础研究进入到了临床分析的领域。由于蛋白质是功能的执行者和药物的直接靶点,因此蛋白质组学在临床方面的应用进展一直备受瞩目。目前的临床蛋白质组学研究,多数仍然是以新鲜或冰冻组织为样本进行的。这些样品往往缺乏足够长的随访信息,导致了其实际的研究意义受限。另一方面,福尔马林固定石蜡包埋(Formalin Fixed Paraffin Embedded, FFPE)是临床一直以来最常用的样品保存方法,这类样品不但数量多、而且时间长、随访信息完整,如果能够将这些样品应用于蛋白质组学分析,无疑会具有更好的临床价值。马克斯普朗克生物化学研究所所长Matthias Mann是蛋白质组学研究领域的一位著名科学家,他在蛋白质组学质谱技术研究方面获得了许多重要的突出成果,改进或者发展了各种新型的技术,曾在Nature Methods,Cell等杂志上发表了一系列这一领域的研究成果。近日,Matthias Mann 团队在预印本BioRxiv上发表题为A streamlined mass spectrometry-based proteomics workflow for large scale FFPE tissue analysis Fabian Coscia的研究论文。介绍了一种基于质谱的蛋白质组学工作流程,可直接从病理...
发布时间: 2019 - 12 - 25
真核生物中,MAPK信号通路是细胞表面传导到细胞核内的重要信号调控通路,在关键的疾病相应,应激响应中都发挥着重要的功能机制。然而,植物中MAPK信号通路的相关作用与分子机制目前知之尚少。日前,山东农业大学郭兴启研究团队,运用定量磷酸化修饰组学针对棉花的抗菌机制开展研究,研究鉴定到一个新的植物MAPK支架蛋白GhMORG1,并揭示其在棉花抗尖孢镰刀菌中的调控作用。相关工作报道在国际知名期刊Plant Biotechnology Journal上。景杰生物为该研究的蛋白质组学、磷酸化修饰组学定量提供了技术支持。研究者首先通过生化实验证实了GhMORG1能够与MAPK信号通路中的GhMKK6蛋白互作。通过靶向基因沉默以及转基因过表达实验,研究者发现GhMORG1蛋白的缺失会造成尖孢镰刀菌感染的增加,而GhMORG1蛋白的存在能够显著降低感染水平。随后,研究者分析了GhMORG1在MAPK信号通路中的作用,发现GhMORG1能够与GhMKK6结合进而增强GhMKK6的活性。为了进一步研究GhMORG1在尖孢镰刀菌感染中发挥作用的分子机制,研究者应用GhMORG1沉默的植物株系与野生型株系,分别在感染尖孢镰刀菌与否情况下分析不同样品中的蛋白质组学与磷酸化修饰组学(组学策略)。通过蛋白质谱分析,总共鉴定到9053个蛋白,此外磷酸化修饰组学共鉴定到2920个蛋白上5065个磷酸化修饰位点(图1)。。。
发布时间: 2019 - 12 - 20
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